Gwastools
doi：10.18129/b9.bioc.gwastools
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅Gwastools。
基因组广泛关联研究工具
生物导体版本：3.12
用于存储非常大的GWAS数据集和注释的类，以及用于GWAS数据清洁和分析的功能。
Author: Stephanie M. Gogarten, Cathy Laurie, Tushar Bhangale, Matthew P. Conomos, Cecelia Laurie, Michael Lawrence, Caitlin McHugh, Ian Painter, Xiuwen Zheng, Jess Shen, Rohit Swarnkar, Adrienne Stilp, Sarah Nelson, David Levine
维护者：Stephanie M. Gogarten
引用（从r内，输入引用（“ Gwastools”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ gwastools”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Gwastools”）
| R脚本 | Gwastools中的数据格式 | |
| R脚本 | GWAS数据清洁 | |
| R脚本 | 准备Affymetrix数据 | |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 |
细节
| 生物浏览 | 遗传因素，，，，微阵列，，，，QualityControl，，，，SNP，，，，软件 |
| 版本 | 1.36.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.9（R-2.14）（9。5年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 生物酶 |
| 进口 | 图形，统计，utils，方法，GDSFMT，，，，DBI，，，，rsqlite，，，，gwasexacthw，，，，DNACOPIGY，，，，生存，，，，三明治，，，，lmtest，，，，logistf，，，，颤抖，，，，Data.Table |
| 链接 | |
| 建议 | NCDF4，，，，Gwasdata，，，，生物基因，，，，运行，，，，生物弦，，，，基因组机，，，，iranges，，，，Snprelate，，，，snpstats，，，，S4VECTORS，，，，变体， 平行 |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/smgogarten/gwastools |
| 取决于我 | Gwasdata，，，，MBPCR |
| 进口我 | 创世纪，，，，Gwasurvivr |
| 建议我 | podkat |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | gwastools_1.36.0.tar.gz |
| Windows二进制 | gwastools_1.36.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | gwastools_1.36.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gwastools |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/gwastools |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gwastools/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
