GSREG

doi:10.18129/b9.bioc.gsreg

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅GSREG

基因集调节(GS-REG)

生物导体版本:3.12

基于表达式变异性以及检测替代剪接事件的方法的基因集分析的包装。它实现了鉴别等级保护(DIRAC)和基因集表达变异分析(EVA)方法。为了检测差异剪接的基因,它提供了剪接eva(SEVA)的实现。

作者:Bahman afsari ,Elana J. Fertig

维护者:jhu.edu>的Bahman Afsari

引用(从r内,输入引用(“ GSREG”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gsreg”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ GSREG”)

PDF R脚本 使用GSREG软件包
PDF 参考手册

细节

生物浏览 替代方案,,,,基因表达,,,,结肠管制,,,,基因烯,,,,遗传因素,,,,途径,,,,软件
版本 1.24.0
在生物导体中 Bioc 3.0(R-3.1)(6。5年)
执照 GPL-2
要看 r(> = 2.13.1),同性恋,,,,org.hs.eg.db,,,,GenomicFeatures,,,,AnnotationDbi
进口
链接
建议 基因组机,,,,GSBENCHMARC
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gsreg_1.24.0.tar.gz
Windows二进制 gsreg_1.24.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) gsreg_1.24.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gsreg
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/gsreg
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/gsreg/
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