gseabase

doi：10.18129/b9.bioc.gseabase

该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅gseabase。

基因集富集数据结构和方法

生物导体版本：3.12

该软件包提供了支持基因集富集分析（GSEA）的类和方法。

作者：马丁·摩根（Martin Morgan），塞思·法尔康（Seth Falcon）

维护者：bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ gseabase”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ gseabase”）

PDF	R脚本	GSEABase简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	去，，，，基因表达，，，，基因烯，，，，GraphandNetwork，，，，kegg，，，，软件
版本	1.52.1
在生物导体中	Bioc 2.1（R-2.6）（13。5年）
执照	艺术2.0
要看	r（> = 2.6.0），生物基因（> = 0.13.8），生物酶（> = 2.17.8），注释（> = 1.45.3），方法，图形（> = 1.37.2）
进口	AnnotationDbi，，，，XML
链接
建议	HGU95AV2.DB，，，，go.db，，，，org.hs.eg.db，，，，rgraphviz，，，，报告工具，，，，测试，，，，生物使用，，，，尼特
系统要求
增强
URL
取决于我	Agdex，，，，Bicare，，，，ccpromise，，，，CPVSNP，，，，GSVADATA，，，，NPGSEA，，，，承诺，，，，碎片，，，，Tissueenrich
进口我	Aucell，，，，生物剂，，，，癌症，，，，类别，，，，类别Compare，，，，CellHTS2，，，，富集兄弟，，，，逃脱，，，，gep2pep，，，，GISPA，，，，Globalancova，，，，GMICR，，，，GSRI，，，，GSVA，，，，Migsa，，，，mirsm，，，，莫格萨，，，，OPPAR，，，，PCPHENO，，，，表，，，，邮政，，，，承诺，，，，rcistarget，，，，报告工具，，，，sctgif，，，，SignaturesEarch，，，，Singlecelltk，，，，唱歌，，，，singscoreamlmutations，，，，激流回旋，，，，tfutils
建议我	生物探测，，，，生物群，，，，量规，，，，全球测试，，，，gostats，，，，GSAR，，，，gsealm，，，，桅杆，，，，PGSEA，，，，表，，，，tfea.chip
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	gseabase_1.52.1.tar.gz
Windows二进制	gseabase_1.52.1.zip
MacOS 10.13（高山脉）	gseabase_1.52.1.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gseabase
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/gseabase
包装短URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/gseabase/
软件包下载报告	下载统计