该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅gostats。
生物导体版本:3.12
一组用于与GO和微阵列数据交互的工具。用于图形,假设测试和其他简单计算的各种基本操纵工具。
作者:Robert Gentleman [Aut],Seth Falcon [CTB],Robert Castelo [CTB],生物处理程序软件包维护器[CRE]
维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>
引用(从r内,输入引用(“ Gostats”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gostats”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ Gostats”)
R脚本 | 较不常见模型生物的高几何测试 | |
R脚本 | 使用GOSTATS进行超几何测试 | |
R脚本 | 使用gostats可视化数据 | |
参考手册 |
生物浏览 | 注解,,,,去,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,GraphandNetwork,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,途径,,,,软件 |
版本 | 2.56.0 |
在生物导体中 | Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 16年) |
执照 | 艺术2.0 |
要看 | r(> = 2.10),生物酶(> = 1.15.29),类别(> = 2.43.2),图形 |
进口 | 方法,统计,Stats4,AnnotationDbi(> = 0.0.89),go.db(> = 1.13.0),rbgl,,,,注释(> = 1.13.2),注释,,,,rgraphviz |
链接 | |
建议 | HGU95AV2.DB(> = 1.13.0),全部,,,,多检验,,,,GeneFilter,,,,rcolorbrewer,,,,Xtable,,,,Sparsem,,,,gseabase,,,,Geneplotter,,,,org.hs.eg.db,,,,运行,,,,生物基因 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | 米尼卡,,,,Plogo2,,,,rdavidwebservice |
进口我 | Affycoretools,,,,吸引,,,,类别Compare,,,,GMICR,,,,理想的,,,,Migsa,,,,Mirlab,,,,PCAEXPLORER,,,,报告工具,,,,sctensor,,,,Systempiper |
建议我 | A4,,,,生物探测,,,,类别,,,,Eisa,,,,fastliquidassociation,,,,gsealm,,,,InteractiveSplay,,,,米尼卡,,,,MLP,,,,mmpalatemirna,,,,qpgraph,,,,rnbeads,,,,安全的 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | gostats_2.56.0.tar.gz |
Windows二进制 | gostats_2.56.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | gostats_2.56.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gostats |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/gostats |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/gostats/ |
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