gostats

doi:10.18129/b9.bioc.gostats

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅gostats

操纵GO和微阵列的工具

生物导体版本:3.12

一组用于与GO和微阵列数据交互的工具。用于图形,假设测试和其他简单计算的各种基本操纵工具。

作者:Robert Gentleman [Aut],Seth Falcon [CTB],Robert Castelo [CTB],生物处理程序软件包维护器[CRE]

维护者:bioconductor.org>的生物导体套件维护器<维护器>

引用(从r内,输入引用(“ Gostats”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ gostats”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Gostats”)

PDF R脚本 较不常见模型生物的高几何测试
PDF R脚本 使用GOSTATS进行超几何测试
PDF R脚本 使用gostats可视化数据
PDF 参考手册

细节

生物浏览 注解,,,,,,,,基因表达,,,,基因烯,,,,GraphandNetwork,,,,微阵列,,,,多重组合,,,,途径,,,,软件
版本 2.56.0
在生物导体中 Bioc 1.6(R-2.1)或更早(> 16年)
执照 艺术2.0
要看 r(> = 2.10),生物酶(> = 1.15.29),类别(> = 2.43.2),图形
进口 方法,统计,Stats4,AnnotationDbi(> = 0.0.89),go.db(> = 1.13.0),rbgl,,,,注释(> = 1.13.2),注释,,,,rgraphviz
链接
建议 HGU95AV2.DB(> = 1.13.0),全部,,,,多检验,,,,GeneFilter,,,,rcolorbrewer,,,,Xtable,,,,Sparsem,,,,gseabase,,,,Geneplotter,,,,org.hs.eg.db,,,,运行,,,,生物基因
系统要求
增强
URL
取决于我 米尼卡,,,,Plogo2,,,,rdavidwebservice
进口我 Affycoretools,,,,吸引,,,,类别Compare,,,,GMICR,,,,理想的,,,,Migsa,,,,Mirlab,,,,PCAEXPLORER,,,,报告工具,,,,sctensor,,,,Systempiper
建议我 A4,,,,生物探测,,,,类别,,,,Eisa,,,,fastliquidassociation,,,,gsealm,,,,InteractiveSplay,,,,米尼卡,,,,MLP,,,,mmpalatemirna,,,,qpgraph,,,,rnbeads,,,,安全的
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 gostats_2.56.0.tar.gz
Windows二进制 gostats_2.56.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) gostats_2.56.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gostats
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/gostats
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/gostats/
软件包下载报告 下载统计

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