此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见还装有.
Bioconductor版本:3.12
为人类基因组找到最具特征的基因本体术语。这个包是作为MI^2集团(http://mi2.mini.pw.edu.pl/, https://github.com/geneticsMiNIng)赞助下开发的论文的一部分创建的。
作者:Lidia Chrabaszcz
维护者:Lidia Chrabaszcz < Chrabaszcz。Lidia在gmail.com>
引文(从R内,输入还装有引文(“”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("GOpro")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
还装有browseVignettes(“”)
超文本标记语言 | R脚本 | GOpro:确定基因组并找到它们的特征GO项 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释,聚类,去,GeneExpression,GeneSetEnrichment,MultipleComparison,软件 |
版本 | 1.16.0 |
在Bioconductor | BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年) |
许可证 | GPL-3 |
取决于 | R (>= 3.4) |
进口 | AnnotationDbi,dendextend,doParallel,foreach平行,org.Hs.eg.db,GO.db,Rcpp,统计,图形,MultiAssayExperiment,IRanges,S4Vectors |
链接 | Rcpp,黑洞 |
建议 | knitr,rmarkdown,RTCGA。PANCAN12,BiocStyle,testthat |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/mi2-warsaw/GOpro |
BugReports | https://github.com/mi2-warsaw/GOpro/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | GOpro_1.16.0.tar.gz |
Windows二进制 | GOpro_1.16.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13 (High Sierra) | GOpro_1.16.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GOpro |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GOpro |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GOpro/ |
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