GGtools

DOI:10.18129 / B9.bioc.GGtools

此包适用于Bioconductor的3.12版本。这个包已经从Bioconductor中移除。有关最后一个稳定的、最新的发布版本,请参见GGtools

用于基因表达遗传学分析的软件和数据

Bioconductor版本:3.12

用于基因表达和/或DNA甲基化遗传学分析的软件和数据

作者:VJ Carey

维护者:VJ Carey

引文(从R中输入引用(“GGtools”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!require ("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

有关较旧版本的R,请参阅适当的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“GGtools”)

PDF R脚本 GGtools: eQTL鉴定软件
PDF 参考手册
文本 自述
文本 新闻

细节

biocViews GeneExpressionGeneticVariability遗传学单核苷酸多态性软件
版本 5.25.3
Bioconductor自 BioC 1.9 (R-2.4)(14.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 2.14),GGBase(> = 3.19.7),data.table平行,Homo.sapiens
进口 方法,跑龙套,统计数据,BiocGenerics(> = 0.25.1),snpStatsffRsamtoolsAnnotationDbiBiobaseVariantAnnotationhexbinrtracklayerGvizstats4,S4Vectors(> = 0.9.25),IRangesGenomeInfoDbGenomicRanges(> = 1.29.6),迭代器BiostringsROCRbiglmggplot2reshape2
链接
建议 GGdatailluminaHumanv1.dbSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37大气气溶胶rmeta
SystemRequirements
增强了 MatrixEQTLforeachdoParallelgwascat
URL
取决于我 ceu1kgeQTL
进口我 ceuhm3GeneGeneInteR
建议我 cgdv17dsQTLGGBasehmyriB36
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用这个包的说明。

源包 GGtools_5.25.3.tar.gz
Windows二进制 GGtools_5.25.3.zip
macOS 10.13 (High Sierra) GGtools_5.25.3.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GGtools
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GGtools
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GGtools/
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