deogetAdb
doi：10.18129/b9.bioc.geometadb
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅deogetAdb。
NCBI GEO的元数据汇编
生物导体版本：3.12
NCBI基因表达综合（GEO）代表了微阵列数据的最大公共存储库。但是，使用当前工具找到感兴趣的数据可能会具有挑战性。GeometADB试图访问与样本，平台和数据集相关的元数据更可行。这是通过将所有NCBI GEO元数据解析为可以在本地存储和查询的SQLite数据库来完成的。GeometAdB只是围绕SQLite数据库的薄包装，以及关联的文档。最后，随着新数据添加到GEO，可以定期更新SQLITE数据库，并且可以随意下载最新的元数据。geometAdb论文：http：//bioinformatics.oxfordjournals.org/cgi/content/short/short/24/23/2798。
作者：杰克·朱和肖恩·戴维斯
维护者：jack zhu
引用（从r内，输入引用（“ quemetAdb”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ geometadb”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
browsevignettes（“ quemetAdb”）
| html | R脚本 | deogetAdb |
| 参考手册 |
细节
| 生物浏览 | 基础设施，，，，软件 |
| 版本 | 1.52.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 2.2（R-2.7）（13年） |
| 执照 | 艺术2.0 |
| 要看 | 地球，，，，rsqlite |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，dplyr，，，，Tm值，，，，WordCloud |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | http://gbnci.abcc.ncifcrf.gov/geo/ |
| 取决于我 | |
| 进口我 | Onassis |
| 建议我 | 抗fofilesdata |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | geometadb_1.52.0.tar.gz |
| Windows二进制 | geometAdb_1.52.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | geometadb_1.52.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/geometadb |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：packages/geometadb |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/geometadb/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
