GENIE3

DOI:10.18129 / B9.bioc.GENIE3

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GENIE3

基因网络推理树的合奏

Bioconductor版本:3.12

这个包实现了GENIE3算法从表达数据推断基因调控网络。

作者:范·安Huynh-Thu Sara Aibar皮埃尔吉尔茨

维护人员:凡安Huynh-Thu < vahuynh在ulg.ac.be >

从内部引用(R,回车引用(“GENIE3”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GENIE3”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GENIE3”)

HTML R脚本 GENIE3
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DecisionTree,GeneExpression,GraphAndNetwork,网络,NetworkInference,回归,软件,SystemsBiology
版本 1.12.0
Bioconductor自 BioC 3.6 (r - 3.4)(3.5年)
许可证 GPL (> = 2)
取决于
进口 统计数据,reshape2
链接
建议 knitr,rmarkdown,foreach,doRNG,doParallel,Biobase,SummarizedExperiment,testthat、方法
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我 MetNet,netbenchmark
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GENIE3_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 GENIE3_1.12.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) GENIE3_1.12.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GENIE3
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GENIE3
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GENIE3/
包下载报告 下载数据

文档»

Bioconductor

R/凹口包和文档

支持»

请阅读发布指南。文章质疑Bioconductor到以下位置:

  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网