这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GENIE3。
Bioconductor版本:3.12
这个包实现了GENIE3算法从表达数据推断基因调控网络。
作者:范·安Huynh-Thu Sara Aibar皮埃尔吉尔茨
维护人员:凡安Huynh-Thu < vahuynh在ulg.ac.be >
从内部引用(R,回车引用(“GENIE3”)
):
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GENIE3”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“GENIE3”)
HTML | R脚本 | GENIE3 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | DecisionTree,GeneExpression,GraphAndNetwork,网络,NetworkInference,回归,软件,SystemsBiology |
版本 | 1.12.0 |
Bioconductor自 | BioC 3.6 (r - 3.4)(3.5年) |
许可证 | GPL (> = 2) |
取决于 | |
进口 | 统计数据,reshape2 |
链接 | |
建议 | knitr,rmarkdown,foreach,doRNG,doParallel,Biobase,SummarizedExperiment,testthat、方法 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | MetNet,netbenchmark |
建议我 | |
我的链接 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
源包 | GENIE3_1.12.0.tar.gz |
Windows二进制 | GENIE3_1.12.0.zip(32位和64位) |
macOS 10.13(高山脉) | GENIE3_1.12.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GENIE3 |
源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GENIE3 |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GENIE3/ |
包下载报告 | 下载数据 |