宝石
DOI:10.18129 / B9.bioc.GEM
这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅宝石。
宝石:快速协会研究相互作用的基因,环境和甲基化
Bioconductor版本:3.12
工具分析ewa、methQTL和GxE基因组广泛。
作者:香港,乔安娜•D霍尔布鲁克Neerja Karnani, Chee-Keong Kwoh
维修工:香港锅< pan_hong在sics.a-star.edu.sg >
从内部引用(R,回车引用(“宝石”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“宝石”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“宝石”)
| HTML | R脚本 | 宝石的用户指南 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | DNAMethylation,GUI,GeneExpression,GenomeWideAssociation,MethylSeq,MethylationArray,回归,单核苷酸多态性,软件 |
| 版本 | 1.16.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.4 (r - 3.3)(4.5年) |
| 许可证 | 艺术- 2.0 |
| 取决于 | R (> = 3.3) |
| 进口 | tcltk,ggplot2、方法、统计grDevices、图形跑龙套 |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,RUnit,testthat,BiocGenerics |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | GEM_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | GEM_1.16.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | GEM_1.16.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GEM |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/宝石 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/GEM/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
