GDSArray

DOI:10.18129 / B9.bioc.GDSArray

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅GDSArray

代表GDS类数组对象文件

Bioconductor版本:3.12

GDS文件被广泛用于表示的基因或序列数据。GDSArray包实现“GDSArray”类来表示节点在GDS文件在一个矩阵像表示,允许简单的操作(如构造子集,数学变换)_R_。磁盘上的数据保持在需要之前,这样可以处理非常大的文件。

作者:钱氏(aut (cre),马丁•摩根(aut) Herve页面(aut) Xiuwen郑(aut)

维护人员:钱氏< qliu7 buffalo.edu >

从内部引用(R,回车引用(“GDSArray”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“GDSArray”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“GDSArray”)

HTML R脚本 GDSArray:代表GDS文件数组类对象
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DataRepresentation,GenotypingArray,基础设施,测序,软件
版本 1.10.1
Bioconductor自 BioC 3.7 (r - 3.5)(3年)
许可证 GPL-3
取决于 R (> = 3.5),gdsfmt、方法、BiocGenerics,DelayedArray(> = 0.5.32)
进口 工具,S4Vectors(> = 0.17.34),SNPRelate,SeqArray
链接
建议 testthat,knitr,BiocStyle,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL https://github.com/Bioconductor/GDSArray
BugReports https://github.com/Bioconductor/GDSArray/issues
取决于我 VariantExperiment
进口我 CNVRanger
建议我 DelayedDataFrame
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 GDSArray_1.10.1.tar.gz
Windows二进制 GDSArray_1.10.1.zip
macOS 10.13(高山脉) GDSArray_1.10.1.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GDSArray
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ GDSArray
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/GDSArray/
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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网