GA4GHclient

DOI:10.18129 / B9.bioc.GA4GHclient

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见GA4GHclient．

用于访问GA4GH API数据服务器的Bioconductor包

Bioconductor版本:3.12

GA4GHclient提供了一种通过全球基因组学和健康联盟(GA4GH)基因组学API访问公共数据服务器的简便方法。它提供了对GA4GH API的低级访问，并将响应数据转换为基于bioconductor的类对象。

作者:Welliton Souza [aut, cre]， Benilton Carvalho [ctb]， Cristiane Rocha [ctb]

维护者:Welliton Souza

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("GA4GHclient")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“GA4GHclient”)

超文本标记语言	R脚本	GA4GHclient
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DataRepresentation，软件，ThirdPartyClient
版本	1.14.0
在Bioconductor	BioC 3.5 (R-3.4)(4年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	S4Vectors
进口	BiocGenerics，Biostrings，dplyr，GenomeInfoDb，GenomicRanges，httr，IRanges，jsonlite、方法、VariantAnnotation
链接
建议	AnnotationDbi，BiocStyle，DT，knitr，org.Hs.eg.db，rmarkdown，testthat，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg19.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/labbcb/GA4GHclient
BugReports	https://github.com/labbcb/GA4GHclient/issues
全靠我	GA4GHshiny
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	GA4GHclient_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	GA4GHclient_1.14.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	GA4GHclient_1.14.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/GA4GHclient
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/GA4GHclient
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/GA4GHclient/
软件包下载报告	下载数据