小伙子

doi:10.18129/b9.bioc.fella

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅小伙子

代谢组学数据的解释和富集

生物导体版本:3.12

使用KEGG条目丰富代谢组学数据。给定一组受影响的化合物,Fella建议使用知识模型网络中使用标签传播的影响反应,酶,模块和途径。可以看到和导出所得的子网。

作者:Sergio Picart-Armada [AUT,CRE],Francesc Fernandez-Albert [aut],Alexandre Perera-llluna [aut]

维护者:sergio picart-armada

引用(从r内,输入引用(“ Fella”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ fella”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Fella”)

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PDF R脚本 示例:镀金头式oxybenzone博览会
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html R脚本 快速开始
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文本 消息

细节

生物浏览 ,,,,GraphandNetwork,,,,kegg,,,,代谢组学,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(3年)
执照 GPL-3
要看 R(> = 3.5.0)
进口 方法,Igraph,,,,矩阵,,,,keggrest,,,,plyr,统计,图形,utils
链接
建议 闪亮的,,,,DT,,,,马格里特,,,,Visnetwork,,,,尼特,,,,生物使用,,,,rmarkDown,,,,测试,,,,Biomart,,,,org.hs.eg.db,,,,org.mm.eg.db,,,,AnnotationDbi,,,,Gosemsim
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
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构建报告

包装档案

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源包 Fella_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 fella_1.10.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Fella_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fella
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/伙伴
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/fella/
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