此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见FCBF.
Bioconductor版本:3.12
这个包为Yu, L.和Liu, H.描述的基于快速相关的过滤器提供了一个简单的R实现;高维数据特征选择:一种基于快速相关的滤波解决方案。20 Intl。相依马赫。学习。(ICML-2003),华盛顿DC, 2003当前的软件包旨在使生物信息学家更容易地使用FCBF进行特征选择,特别是关于转录组数据。这意味着在计算解释类的特征(但不能被其他特征预测)之前离散表达式(function discretize_exprs)。这些函数是基于Yu和Liu, 2003的算法和Rajarshi Guha从2005年5月13日(截至2018年8月26日)在http://www.rguha.net/code/R/fcbf.R上实现的。
作者:Tiago Lubiana [aut, cre], Helder Nakaya [aut, ths]
维护者:Tiago Lubiana < Tiago . Lubiana。阿尔维斯在usp.br>
引文(从R内,输入引用(“FCBF”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("FCBF")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“FCBF”)
超文本标记语言 | R脚本 | FCBF:基于快速相关的特征选择滤波器 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | 分类,FeatureExtraction,GeneExpression,GeneTarget,ImmunoOncology,SingleCell,软件 |
版本 | 1.8.0 |
在Bioconductor | BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | R (>= 3.6) |
进口 | ggplot2,gridExtra,pbapply平行,SummarizedExperiment统计数据,mclust |
链接 | |
建议 | 脱字符号,mlbench,SingleCellExperiment,knitr,rmarkdown,testthat,BiocManager |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
全靠我 | |
进口我 | fcoex |
建议我 | PubScore |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | FCBF_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | FCBF_1.8.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | FCBF_1.8.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/FCBF |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/FCBF |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/FCBF/ |
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