此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ExploreModelMatrix.
Bioconductor版本:3.12
给定一个示例数据表和一个设计公式,ExploreModelMatrix生成一个交互式应用程序,用于探索结果设计矩阵。这有助于解释模型系数和在(广义)线性模型中构建适当的对比。还可以生成静态可视化。
作者:Charlotte Soneson [aut, cre],费德里科·马里尼[aut],迈克尔·洛夫[au],弗洛里安·盖尔[au],迈克尔·施塔德勒[作者]
维护者:Charlotte Soneson
引文(从R内,输入引用(“ExploreModelMatrix”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("ExploreModelMatrix")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“ExploreModelMatrix”)
超文本标记语言 | R脚本 | ExploreModelMatrix |
超文本标记语言 | R脚本 | ExploreModelMatrix-deploy |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 | |
文本 | 许可证 |
biocViews | DifferentialExpression,ExperimentalDesign,回归,软件 |
版本 | 1.2.0 |
在Bioconductor | BioC 3.11 (R-4.0)(1年) |
许可证 | MIT +文件许可证 |
取决于 | |
进口 | 闪亮的(> = 1.5.0),shinydashboard,DT,cowplot跑龙套,dplyr,magrittr,tidyr,ggplot2,统计,方法,rintrojs,尺度,宠物猫,质量,limma,S4Vectors,shinyjs |
链接 | |
建议 | testthat(> =魅惑,knitr,rmarkdown,htmltools,BiocStyle |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | https://github.com/csoneson/ExploreModelMatrix |
BugReports | https://github.com/csoneson/ExploreModelMatrix/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | ExploreModelMatrix_1.2.0.tar.gz |
Windows二进制 | ExploreModelMatrix_1.2.0.zip |
macOS 10.13 (High Sierra) | ExploreModelMatrix_1.2.0.tgz |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ExploreModelMatrix |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ExploreModelMatrix |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/ExploreModelMatrix/ |
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