EpiTxDb

DOI:10.18129 / B9.bioc.EpiTxDb

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见EpiTxDb．

使用AnnotationDbi接口存储和访问外延脚本组信息

Bioconductor版本:3.12

外延数据库便于外延组信息的存储。更具体地说，它可以跟踪修饰的身份、位置、将其引入RNA上的酶、决定要修饰的RNA上的位置的说明符以及与每个修饰相关的文献参考。

作者:Felix G.M. Ernst [aut, cre]

维护者:Felix G.M. Ernst < Felix .gm。恩斯特在outlook.com>上写道

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“EpiTxDb”)

超文本标记语言	R脚本	EpiTxDb
超文本标记语言	R脚本	EpiTxDb-creation
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	Epitranscriptomics，软件
版本	1.2.1 "
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0)，AnnotationDbi，Modstrings
进口	方法,跑龙套,httr，xml2，旋度，GenomicFeatures，GenomicRanges，GenomeInfoDb，BiocGenerics，BiocFileCache，S4Vectors，IRanges，RSQLite，DBI，Biostrings，tRNAdbImport
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，httptest，AnnotationHub，ensembldb，ggplot2，EpiTxDb.Hs.hg38，BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38，BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3，TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb
BugReports	https://github.com/FelixErnst/EpiTxDb/issues
全靠我	EpiTxDb.Hs.hg38，EpiTxDb.Mm.mm10，EpiTxDb.Sc.sacCer3
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	EpiTxDb_1.2.1.tar.gz
Windows二进制	EpiTxDb_1.2.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	EpiTxDb_1.2.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EpiTxDb
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EpiTxDb
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/EpiTxDb/
软件包下载报告	下载数据