该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅easyqpcr。
生物导体版本:3.12
该软件包基于Hellemans等人发布的QBase算法。在2007年。easyqpcr软件包允许您如Vignette中所述轻松导入QPCR数据文件。此后,您可以根据所选择的最佳参考基因(使用SLQPCR软件包),然后计算出扩增效率,相对数量及其标准误差,标准化因子,然后是归一化的相对数量,NRQ缩放到您的控制范围及其标准误差。该软件包是为低通量QPCR数据分析而创建的。
作者:Le Pape Sylvain
维护者:le pape sylvain
引用(从r内,输入引用(“ easyqpcr”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ easyqpcr”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ easyqpcr”)
R脚本 | easyqpcr | |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 基因表达,,,,软件,,,,qpcr |
版本 | 1.31.0 |
在生物导体中 | Bioc 2.11(R-2.15)(8。5年) |
执照 | GPL(> = 2) |
要看 | |
进口 | plyr,,,,矩阵,,,,plotrix,gwidgetSrgtk2 |
链接 | |
建议 | slqpcr,,,,qpcrnorm,,,,qpcr,,,,尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | easyqpcr_1.31.0.tar.gz |
Windows二进制 | easyqpcr_1.31.0.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | easyqpcr_1.31.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/easyqpcr |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/easyqpcr |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/easyqpcr/ |
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