肘

DOI:10.18129 / B9.bioc.ELBOW

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见肘．

肘关节-通过lOgit方法评估折叠变化

Bioconductor版本:3.12

肘部是一种改进的折叠变化检验，它使用聚类分析和模式识别来设置截断极限，直接从复制内方差中获得，而无需假设只有2个生物重复的正态分布。弯头在跨平台分析中也提供了与折叠测试相同的一致性。采用T检验和微阵列统计分析(12个重复，初始条件和最终条件各6个重复)对肘关节的假阳性和假阴性率进行评估时，肘关节的假阳性和假阴性率低于标准折叠试验。肘关节提供了一个基于初始条件复制的空值，并给出了结果的误差界限，以便更好地评估显著性。

作者:张向丽，Natalie Bjorklund, Graham Alvare, Tom Ryzdak, Richard Sparling, Brian Fristensky

维护者:Graham Alvare < Alvare at cc.umanitoba。ca>，张湘丽

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("肘")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“肘部”)

PDF	R脚本	使用肘部——肘部权威教程
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	GeneExpression,ImmunoOncology,微阵列,多通道,OneChannel,RNASeq,测序,软件,技术,TwoChannel
版本	1.26.0
在Bioconductor	BioC 2.14 (R-3.1)(7年)
许可证	文件许可证
取决于	R (>= 2.15.0)
进口	图形，统计，效用
链接
建议	DESeq,GEOquery,limma,simpleaffy,affyPLM,RColorBrewer,hgu133plus2cdf,hgu133plus2probe
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	ELBOW_1.26.0.tar.gz
Windows二进制	ELBOW_1.26.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	ELBOW_1.26.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ELBOW
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/肘部
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ELBOW/
软件包下载报告	下载数据