埃达
DOI:10.18129 / B9.bioc.EDDA
此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见埃达．
差异丰度分析的实验设计
Bioconductor版本:3.12
EDDA可以帮助设计一系列常见的实验，如RNA-seq、纳米串分析、RIP-seq和宏基因组测序，并使研究人员能够全面研究实验决策对检测差异丰度能力的影响。这项工作发表在2014年12月3日的Genome Biology上，标题为“高通量实验中检测差异丰富特征的研究设计的重要性”(http://genomebiology.com/2014/15/12/527)。
作者:李俊涛，罗怀恩，Chia Kuan Hui Burton, Niranjan Nagarajan
维护者:Chia Kuan Hui Burton
引文(从R内，输入引用(“埃达”))：
安装
要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("EDDA")
对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．
文档
要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:
browseVignettes(“埃达”)
| 《埃达》插曲 | ||
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 |
细节
| biocViews | ChIPSeq，ExperimentalDesign，ImmunoOncology，归一化，RNASeq，测序，软件 |
| 版本 | 1.28.0 |
| 在Bioconductor | BioC 2.14 (R-3.1)(7年) |
| 许可证 | GPL (>= 2) |
| 取决于 | Rcpp(>= 0.10.4)，并行，方法，ROCR，DESeq，baySeq，雪，刨边机 |
| 进口 | 图形，统计，utils，并行，方法，ROCR，DESeq，baySeq，雪，刨边机 |
| 链接 | Rcpp |
| 建议 | |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | http://edda.gis.a-star.edu.sg/http://genomebiology.com/2014/15/12/527 |
| 全靠我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
| 源包 | EDDA_1.28.0.tar.gz |
| Windows二进制 | EDDA_1.28.0.zip(32位和64位) |
| macOS 10.13 (High Sierra) | EDDA_1.28.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/EDDA |
| 源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/EDDA |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/EDDA/ |
| 软件包下载报告 | 下载数据 |
