沙丘
DOI:10.18129 / B9.bioc.Dune
这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅沙丘。
改善单细胞RNA-Seq复现性细胞类型的发现
Bioconductor版本:3.12
给定一组聚类标签,沙丘合并对集群之间的增加意味着ARI标签,提高复现性。
作者:赫克托耳Roux de Bezieux (aut (cre)
街,凯利(aut)
维修工:赫克托耳Roux de Bezieux <赫克托耳。在berkeley.edu rouxdebezieux >
从内部引用(R,回车引用(“沙丘”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“沙丘”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“沙丘”)
| HTML | R脚本 | 沙丘装饰图案 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 新闻 | |
| 文本 | 许可证 |
细节
| biocViews | 聚类,GeneExpression,RNASeq,SingleCell,软件,转录组,可视化 |
| 版本 | 1.2.0 |
| Bioconductor自 | BioC 3.11 (r - 4.0)(1年) |
| 许可证 | 麻省理工学院+文件许可证 |
| 取决于 | R (> = 4.0) |
| 进口 | BiocParallel,SummarizedExperiment,mclust跑龙套,ggplot2,dplyr,tidyr,RColorBrewer,magrittr,gganimate,purrr |
| 链接 | |
| 建议 | knitr,rmarkdown,testthat(> = 2.1.0的) |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | Dune_1.2.0.tar.gz |
| Windows二进制 | Dune_1.2.0.zip |
| macOS 10.13(高山脉) | Dune_1.2.0.tgz |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/Dune |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/沙丘 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/Dune/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
