DiscoRhythm

DOI:10.18129 / B9.bioc.DiscoRhythm

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DiscoRhythm．

在生物数据中发现节律性的交互式工作流

Bioconductor版本:3.12

用于估计周期特征(如周期、相位、振幅和大型时间数据集中的统计显著性)的函数集。支持质量控制、降维、光谱分析、实验重复分析等功能。包含一个R Shiny web界面来执行所有的工作流步骤。

作者:Matthew Carlucci [aut, cre]， Algimantas krizyiwonnas [aut]， Haohan Li [aut]， Povilas Gibas [aut]， Karolis konceviius [aut]， Art Petronis [aut]， Gabriel Oh [aut]

维护者:Matthew Carlucci

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DiscoRhythm")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DiscoRhythm”)

超文本标记语言	R脚本	discorrhythm简介
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GUI，PrincipalComponent，质量控制，软件，TimeCourse，可视化
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6.0)
进口	matrixTests，matrixStats，MetaCycle(> = 1.2.0),data.table，ggplot2，ggExtra，dplyr，扫帚，闪亮的，shinyBS，shinycssloaders，shinydashboard，shinyjs，BiocStyle，rmarkdown，knitr，kableExtra，魔法，维恩图，UpSetR，的热图，冬青，情节，DT，gridExtra，方法，统计，SummarizedExperiment，BiocGenerics，S4Vectors，邮政编码，reshape2
链接
建议	testthat
SystemRequirements	要生成html报告，需要pandoc (http://pandoc.org/installing.html)。
增强了
URL	https://github.com/matthewcarlucci/DiscoRhythm
BugReports	https://github.com/matthewcarlucci/DiscoRhythm/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DiscoRhythm_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	DiscoRhythm_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	DiscoRhythm_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DiscoRhythm
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ discorrhythm
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DiscoRhythm/
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