DelayedMatrixStats

DOI:10.18129 / B9.bioc.DelayedMatrixStats

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DelayedMatrixStats．

适用于'DelayedMatrix'对象的行和列的函数

Bioconductor版本:3.12

'matrixStats' API的一个端口，用于使用'DelayedArray'包中的DelayedMatrix对象。在DelayedMatrix对象的行和列上操作的高性能函数，例如col / rowMedians()， col / rowRanks()和col / rowSds()。针对每个数据类型和子集计算优化的函数，从而使内存使用和处理时间最小化。

作者:Peter Hickey [aut, cre]， Hervé Pagès [ctb]， Aaron Lun [ctb]

维护者:Peter Hickey < Peter。Hickey在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DelayedMatrixStats")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DelayedMatrixStats”)

超文本标记语言	R脚本	DelayedMatrixStats概述
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	DataRepresentation，基础设施，软件
版本	1.12.3
在Bioconductor	BioC 3.6 (R-3.4)(3.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	MatrixGenerics，DelayedArray(> = 0.15.3)
进口	方法,matrixStats(> = 0.56.0),sparseMatrixStats，矩阵，S4Vectors(> = 0.17.5),IRanges，HDF5Array(> = 1.17.2),BiocParallel
链接
建议	testthat，knitr，rmarkdown，covr，BiocStyle，微基准测试，profmem
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/PeteHaitch/DelayedMatrixStats
BugReports	https://github.com/PeteHaitch/DelayedMatrixStats/issues
全靠我
进口我	后面;，biscuiteer，bsseq，celldex，dmrseq，弗雷泽，glmGamPoi，methrix，methylSig，minfi，PCAtools，嘘，scMerge，食物，天窗，singleCellTK，单，weitrix
建议我	DelayedArray，MatrixGenerics，mbkmeans，scPCA
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DelayedMatrixStats_1.12.3.tar.gz
Windows二进制	DelayedMatrixStats_1.12.3.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	DelayedMatrixStats_1.12.3.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DelayedMatrixStats
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DelayedMatrixStats
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DelayedMatrixStats/
软件包下载报告	下载数据