DNAshapeR

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNAshapeR

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DNAshapeR。

高通量预测DNA的形状特征

Bioconductor版本:3.12

DNAhapeR是超高速的R / BioConductor包,高通量预测DNA的形状特征。包允许预测、可视化和编码DNA为统计学习形状特性。

作者:赵Tsu-Pei和费德里科•Comoglio

维护人员:Tsu-Pei赵< tsupeich usc.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DNAshapeR”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DNAshapeR”)

HTML	R脚本	DNAshapeR
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DNA3DStructure,软件,StructuralPrediction
版本	1.18.0
Bioconductor自	BioC 3.3 (r - 3.3)(5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4),GenomicRanges
进口	Rcpp(> = 0.12.1),Biostrings,字段
链接	Rcpp
建议	AnnotationHub,knitr,rmarkdown,testthat,BSgenome.Scerevisiae.UCSC.sacCer3,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg19,脱字符号
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DNAshapeR_1.18.0.tar.gz
Windows二进制	DNAshapeR_1.18.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	DNAshapeR_1.18.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAshapeR
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DNAshapeR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DNAshapeR/
包下载报告	下载数据