DNAcopy

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNAcopy

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DNAcopy．

DNA拷贝数数据分析

Bioconductor版本:3.12

采用循环二进制分割(CBS)算法对DNA拷贝数数据进行分割，识别拷贝数异常的基因组区域。

作者:Venkatraman E. Seshan, Adam Olshen

维护者:Venkatraman E. Seshan

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("DNAcopy")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DNAcopy”)

PDF	R脚本	DNAcopy
PDF		参考手册

细节

biocViews	CopyNumberVariation，微阵列，软件
版本	1.64.0
在Bioconductor	BioC 1.6 (R-2.1)或更早(> 16年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于
进口
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	CGHcall，cghMCR，单克隆，CRImage，PureCN
进口我	ADaCGH2，AneuFinder，ArrayTV，冠军，cn.farms，CNAnorm，CNVrd2，contiBAIT，conumee，文案，GWASTools，联合化疗，MEDIPS，MethCP，MinimumDistance，QDNAseq，rCGH，Repitools，范围，芝麻，snapCGH
建议我	beadarraySNP，cn.mops，CopyNumberPlots，fastseg，genoset
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DNAcopy_1.64.0.tar.gz
Windows二进制	DNAcopy_1.64.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	DNAcopy_1.64.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNAcopy
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DNAcopy
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DNAcopy/
软件包下载报告	下载数据