DNABarcodes

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNABarcodes

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DNABarcodes。

一个工具用于创建和分析DNA条形码用于下一代测序多路复用实验

Bioconductor版本:3.12

包提供了一个函数来创建DNA条形码集能够纠正插入,删除,替换错误。现有的条形码可以分析关于最小,最大和平均距离条形码。最后,读,开始(可能突变)条形码可以去复用,即。原始参考条形码,分配给他们。

作者:Tilo Buschmann < tilo.buschmann。交流在gmail.com >

维护人员:Tilo Buschmann < tilo.buschmann。交流在gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DNABarcodes”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DNABarcodes”)

HTML	R脚本	DNABarcodes
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	预处理,测序,软件
版本	1.20.0
Bioconductor自	BioC 3.2 (r - 3.2)(5.5年)
许可证	GPL-2
取决于	矩阵、并行
进口	Rcpp(> = 0.11.2),黑洞
链接	Rcpp,黑洞
建议	knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我	DNABarcodeCompatibility
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DNABarcodes_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	DNABarcodes_1.20.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	DNABarcodes_1.20.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNABarcodes
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DNABarcodes
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DNABarcodes/
包下载报告	下载数据