DNABarcodes

DOI:10.18129 / B9.bioc.DNABarcodes

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DNABarcodes

一个工具用于创建和分析DNA条形码用于下一代测序多路复用实验

Bioconductor版本:3.12

包提供了一个函数来创建DNA条形码集能够纠正插入,删除,替换错误。现有的条形码可以分析关于最小,最大和平均距离条形码。最后,读,开始(可能突变)条形码可以去复用,即。原始参考条形码,分配给他们。

作者:Tilo Buschmann < tilo.buschmann。交流在gmail.com >

维护人员:Tilo Buschmann < tilo.buschmann。交流在gmail.com >

从内部引用(R,回车引用(“DNABarcodes”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DNABarcodes”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

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HTML R脚本 DNABarcodes
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文本 新闻

细节

biocViews 预处理,测序,软件
版本 1.20.0
Bioconductor自 BioC 3.2 (r - 3.2)(5.5年)
许可证 GPL-2
取决于 矩阵、并行
进口 Rcpp(> = 0.11.2),黑洞
链接 Rcpp,黑洞
建议 knitr,BiocStyle,rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我 DNABarcodeCompatibility
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 DNABarcodes_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 DNABarcodes_1.20.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉) DNABarcodes_1.20.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DNABarcodes
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DNABarcodes
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/DNABarcodes/
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