DEGseq

DOI:10.18129 / B9.bioc.DEGseq

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅DEGseq。

从RNA-seq数据识别差异表达基因

Bioconductor版本:3.12

DEGseq R包从RNA-Seq数据识别差异表达基因。

作者:王Likun < wanglk hsc.pku.edu.cn >和习近平王< wang-xi05 mails.tsinghua.edu.cn >。

维护人员:王Likun < wanglk hsc.pku.edu.cn >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“DEGseq”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“DEGseq”)

PDF	R脚本	DEGseq
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression,GeneExpression,ImmunoOncology,预处理,RNASeq,软件
版本	1.44.0
Bioconductor自	BioC 2.5 (r - 2.10)(11.5年)
许可证	LGPL (> = 2)
取决于	R (> = 2.8.0),qvalue、方法
进口	图形、grDevices方法、统计跑龙套
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	DEGseq_1.44.0.tar.gz
Windows二进制	DEGseq_1.44.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	DEGseq_1.44.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DEGseq
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ DEGseq
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DEGseq/
包下载报告	下载数据