分解疾病

doi:10.18129/b9.bioc.decomplexdisease

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅分解疾病

通过双聚类分析,用于差异表达分析和基于DEG的复杂疾病的工具

生物导体版本:3.12

它旨在找到复杂疾病的差异表达基因(DEG),其特征在于异质基因组表达谱。与已建立的DEG分析工具不同,它不假定复杂疾病的患者共享共同的DEG。通过应用双聚类算法,DECD找到了许多患者共享的DEG。通过这种方式,DECD描述了一种新型语法中的复杂疾病的学位,例如由30%的研究复杂疾病中的30%的基因列表差异表达。应用DECD分析结果,用户可以根据共享签名找到受相同机制影响的患者。

作者:Guofeng Meng

维护者:Guofeng Meng

引用(从r内,输入引用(“ DemplexDisease”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ decomplexdisease”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ DemplexDisease”)

PDF DemplexDisease:用于DE分析的R包装
html R脚本 DemplexDisease:用于DE分析的R包装
PDF 参考手册
文本 消息

细节

生物浏览 聚类,,,,dnaseq,,,,差异性,,,,功能基因组学,,,,基因表达,,,,软件,,,,全媒体
版本 1.10.0
在生物导体中 Bioc 3.7(R-3.5)(3年)
执照 GPL-3
要看 r(> = 3.3.3)
进口 RCPP(> = 0.12.7),deseq2,,,,EDGER,,,,总结性特征,,,,复杂的图像,网格,平行,生物比较,grdevices,图形,统计,方法,utils
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源包 demplexdisease_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 demplexdisease_1.10.0.zip(32-和64位)
MacOS 10.13(高山脉) demplexdisease_1.10.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/decomplexdisease
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/demplexdisease
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/decomplexdisease/
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