该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅分解疾病。
生物导体版本:3.12
它旨在找到复杂疾病的差异表达基因(DEG),其特征在于异质基因组表达谱。与已建立的DEG分析工具不同,它不假定复杂疾病的患者共享共同的DEG。通过应用双聚类算法,DECD找到了许多患者共享的DEG。通过这种方式,DECD描述了一种新型语法中的复杂疾病的学位,例如由30%的研究复杂疾病中的30%的基因列表差异表达。应用DECD分析结果,用户可以根据共享签名找到受相同机制影响的患者。
作者:Guofeng Meng
维护者:Guofeng Meng
引用(从r内,输入引用(“ DemplexDisease”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ decomplexdisease”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
Browsevignettes(“ DemplexDisease”)
DemplexDisease:用于DE分析的R包装 | ||
html | R脚本 | DemplexDisease:用于DE分析的R包装 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 聚类,,,,dnaseq,,,,差异性,,,,功能基因组学,,,,基因表达,,,,软件,,,,全媒体 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(3年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | r(> = 3.3.3) |
进口 | RCPP(> = 0.12.7),deseq2,,,,EDGER,,,,总结性特征,,,,复杂的图像,网格,平行,生物比较,grdevices,图形,统计,方法,utils |
链接 | RCPP |
建议 | 尼特 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | demplexdisease_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | demplexdisease_1.10.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | demplexdisease_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/decomplexdisease |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:packages/demplexdisease |
包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/decomplexdisease/ |
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