DAPAR

DOI:10.18129 / B9.bioc.DAPAR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见DAPAR．

蛋白质丰度差异分析工具与R

Bioconductor版本:3.12

这个包包含了蛋白质组数据可视化和统计分析的功能集合。

作者:Samuel Wieczorek [cre,aut]， Florence Combes [aut]， Thomas Burger [aut]， Cosmin Lazar [ctb]， Alexia Dorffer [ctb]， Anais Courtier [ctb]， Helene Borges [ctb]， Enora Fremy [ctb]

维护者:Samuel Wieczorek < Samuel。Wieczorek在cea.fr>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("DAPAR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“DAPAR”)

PDF	R脚本	Prostar用户手册
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文本		新闻

细节

biocViews	DataImport，去，MassSpectrometry，归一化，预处理，蛋白质组学，质量控制，软件
版本	1.22.9
在Bioconductor	BioC 3.2 (R-3.2)(5.5年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R (>= 4.0.3)
进口	Biobase，MSnbase，宠物猫，RColorBrewer统计数据,preprocessCore，开罗，png，晶格，reshape2，gplots，pcaMethods，ggplot2，limma，knitr，tmvtnorm，规范，嫁祸于，stringr， grDevices，图形，openxlsx跑龙套,cp4p(> = 0.3.5),尺度，矩阵，vioplot，imp4p(> = 0.8),forcats、方法、highcharter，DAPARdata(> = 1.18.0),siggenes，图，lme4，readxl，clusterProfiler，dplyr，tidyr，AnnotationDbi，tidyverse，vsn，FactoMineR，factoextra，multcomp，purrr，visNetwork，foreach平行,doParallel，igraph，dendextend，Mfuzz，apcluster，diptest，集群
链接
建议	BiocGenerics，testthat，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	http://www.prostar-proteomics.org/
BugReports	https://github.com/samWieczorek/DAPAR/issues
全靠我
进口我	Prostar
建议我	DAPARdata
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	DAPAR_1.22.9.tar.gz
Windows二进制	DAPAR_1.22.9.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	DAPAR_1.22.9.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/DAPAR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/DAPAR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/DAPAR/
软件包下载报告	下载数据