CoRegFlux

DOI:10.18129 / B9.bioc.CoRegFlux

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CoRegFlux．

CoRegFlux

Bioconductor版本:3.12

CoRegFlux旨在提供工具，将逆向工程基因调控网络和基因表达整合到代谢模型中，通过转录因子或基因(TF)在各种条件下的敲除或过表达，提高代谢工程的表型预测，以及提高我们对相互作用和细胞内部工作的理解。

作者:Pauline Trébulle, Daniel Trejo-Banos, Mohamed Elati

维护者:Pauline Trébulle和Mohamed Elati

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("CoRegFlux")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CoRegFlux”)

超文本标记语言	R脚本	CoRegFlux
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneExpression，GenePrediction，GeneRegulation，网络，软件，SystemsBiology，转录
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6)
进口	CoRegNet，西比尔
链接
建议	glpkAPI，testthat，knitr，rmarkdown，消化，R.cache，ggplot2，plyr，igraph、方法、latex2exp，rBayesianOptimization
SystemRequirements	GLPK (>= 4.42)
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CoRegFlux_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	CoRegFlux_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	CoRegFlux_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CoRegFlux
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CoRegFlux
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CoRegFlux/
软件包下载报告	下载数据