CexoR

DOI:10.18129 / B9.bioc.CexoR

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见CexoR．

在ChIP-exo复制中发现高分辨率蛋白质- dna相互作用的R包

Bioconductor版本:3.12

ChIP-exo复制中的特定链峰对调用。累积Skellam分布函数(包“Skellam”)用于检测每条DNA链(峰对)上相对符号的显著归一化计数差异。生物重复中重叠峰对的不可复制发现率(IDR)是使用包“IDR”来估计的。

作者:Pedro Madrigal <生物信息学。gmail.com>的工程师

维护者:Pedro Madrigal <生物信息学。gmail.com>的工程师

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("CexoR")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“CexoR”)

PDF	R脚本	CexoR装饰图案
PDF		参考手册
文本		许可证

细节

biocViews	遗传学，测序，软件，转录
版本	1.28.0
在Bioconductor	BioC 2.13 (R-3.0)(7.5年)
许可证	art -2.0 | GPL-2 +文件许可证
取决于	R (>= 2.10.0)，S4Vectors，IRanges
进口	Rsamtools，GenomeInfoDb，GenomicRanges，rtracklayer，印尼盾，RColorBrewer，genomation
链接
建议	RUnit，BiocGenerics，BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	CexoR_1.28.0.tar.gz
Windows二进制	CexoR_1.28.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	CexoR_1.28.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CexoR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/CexoR
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CexoR/
软件包下载报告	下载数据