CancerInSilico

DOI:10.18129 / B9.bioc.CancerInSilico

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅CancerInSilico。

一个R界面肿瘤恶化的计算模型

Bioconductor版本:3.12

CancerInSilico包提供了一个R界面运行数学模型的肿瘤progresson和生成的基因表达数据的结果。这个包在c++中实现底层模型和实现的输出和分析功能。

作者:托马斯·d·谢尔曼Raymond Cheng伊j .多数

维修工:托马斯·d·谢尔曼< tomsherman159 gmail.com >伊j .多数< ejfertig jhmi.edu >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“CancerInSilico”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“CancerInSilico”)

HTML	R脚本	CancerInSilico包
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	BiomedicalInformatics,CellBiology,GeneExpression,ImmunoOncology,MathematicalBiology,RNASeq,SingleCell,软件,SystemsBiology
版本	2.10.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(4.5年)
许可证	GPL-2
取决于	R (> = 3.4),Rcpp
进口	方法,跑龙套,图形,统计数据
链接	Rcpp,黑洞
建议	testthat,knitr,rmarkdown,BiocStyle,Rtsne,冬青,rgl,gplots
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	CancerInSilico_2.10.0.tar.gz
Windows二进制	CancerInSilico_2.10.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13(高山脉)	CancerInSilico_2.10.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/CancerInSilico
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ CancerInSilico
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/CancerInSilico/
包下载报告	下载数据