食典委

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅食典委。

标准化和拷贝数变异检测方法全外显子组测序

Bioconductor版本:3.12

归一化和DNA拷贝数变异过程呼吁全外显子组测序数据。法典依赖于可用性的多个样品使用相同的测序管道为归一化处理,并且不需要匹配控制。法典中的归一化模型包括条款,特别是由于GC含量,消除偏见外显子长度和定位和扩增效率和潜在的系统性工件。食典委还包括一个基于泊松基于可能性递归分割过程,明确模型点外显子组测序数据。

作者:江刘宇超(音),南希·r·张

维护人员:江刘宇超(音)在wharton.upenn.edu < yuchaoj >

从内部引用(R,回车引用(“法典”)):

安装

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如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“法典”)

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文档

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browseVignettes(“法典”)

PDF	R脚本	使用食品
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细节

biocViews	CopyNumberVariation,ExomeSeq,ImmunoOncology,归一化,质量控制,软件
版本	1.22.0