切塔
doi：10.18129/b9.bioc.chetah
该包适用于生物导体的3.12版；对于稳定的最新版本，请参阅切塔。
快速准确的SCRNA-seq细胞类型识别
生物导体版本：3.12
CHETAH（通过分层分类协助的细胞类型的表征）是一种准确，选择性和快速的SCRNA-SECEQ分类器。分类以参考数据集为指导，优先也是SCRNA-SEQ数据集。通过对参考数据的层次结构聚类，Chetah创建了一个分类树，可以实现逐步的，底部的分类。Chetah使用新颖的停止规则将输入单元格分类为参考的细胞类型和“中间类型”：以树的中间节点结尾的更通用的分类。
作者：Jurrian de Kanter [AUT，CRE]，Philip Lijnzaad [aut]
维护者：gmail.com上的Jurrian de Kanter
引用（从r内，输入引用（“ Chetah”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：
if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ chetah”）
对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。
文档
要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：
Browsevignettes（“ Chetah”）
| html | R脚本 | Chetah包装简介 |
| 参考手册 | ||
| 文本 | 消息 | |
| 文本 | 执照 |
细节
| 生物浏览 | 分类，，，，聚类，，，，rnaseq，，，，Singlecell，，，，软件 |
| 版本 | 1.6.0 |
| 在生物导体中 | Bioc 3.9（R-3.6）（2年） |
| 执照 | 文件执照 |
| 要看 | r（> = 3.6），GGPLOT2，，，，Singlecellexperiment |
| 进口 | GPLOTS，，，，闪亮的，，，，情节，，，，pheatmap，，，，生物学家，，，，Dendextend，，，，牛仔图，，，，Corrplot，grdevices，统计，图形，RESHAPE2，，，，S4VECTORS，，，，总结性特征 |
| 链接 | |
| 建议 | 尼特，，，，rmarkDown，，，，矩阵，，，，测试，，，，VDIFFR |
| 系统要求 | |
| 增强 | |
| URL | https://github.com/jdekanter/chetah |
| BugReports | https://github.com/jdekanter/chetah |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接到我 | |
| 构建报告 |
包装档案
跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。
| 源包 | chetah_1.6.0.tar.gz |
| Windows二进制 | chetah_1.6.0.zip |
| MacOS 10.13（高山脉） | chetah_1.6.0.tgz |
| 源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/chetah |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.bioconductor.org：包装/chetah |
| 包装短URL | //www.anjoumacpherson.com/packages/chetah/ |
| 软件包下载报告 | 下载统计 |
