BiocWorkflowTools

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocWorkflowTools

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BiocWorkflowTools。

工具来援助Bioconductor工作流软件包的开发

Bioconductor版本:3.12

提供函数来缓解Rmarkdown之间的过渡和乳胶文档当创作Bioconductor工作流。

作者:迈克·史密斯(aut (cre) Andrzej Oleś(aut)

维护人员:迈克史密斯< grimbough gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BiocWorkflowTools”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BiocWorkflowTools”)

HTML	R脚本	转换Rmarkdown F1000Research乳胶格式
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	ReportWriting,软件
版本	1.16.0
Bioconductor自	BioC 3.4 (r - 3.3)(4.5年)
许可证	麻省理工学院+文件许可证
取决于	R (> = 3.4)
进口	BiocStyle,bookdown,git2r,httr,knitr,rmarkdown,rstudioapi,stringr、工具、跑龙套usethis
链接
建议
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我	RNAseq123
进口我
建议我	BiocMetaWorkflow,CAGEWorkflow,recountWorkflow,SingscoreAMLMutations
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	BiocWorkflowTools_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	BiocWorkflowTools_1.16.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	BiocWorkflowTools_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocWorkflowTools
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocWorkflowTools
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocWorkflowTools/
包下载报告	下载数据