BiocGenerics

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocGenerics

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BiocGenerics．

在Bioconductor中使用的S4通用函数

Bioconductor版本:3.12

这个包定义了在Bioconductor中使用的S4通用函数。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("BiocGenerics")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	基础设施，软件
版本	0.36.1
在Bioconductor	BioC 2.10 (R-2.15)(9年)
许可证	艺术- 2.0
取决于	R(>= 4.0.0)，方法，utils，图形，统计，并行
进口	方法，utils，图形，统计，并行
链接
建议	Biobase，S4Vectors，IRanges，GenomicRanges，DelayedArray，Biostrings，Rsamtools，AnnotationDbi，affy，affyPLM，DESeq2，flowClust，MSnbase，注释，RUnit
SystemRequirements
增强了
URL	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocGenerics
BugReports	https://github.com/Bioconductor/BiocGenerics/issues
全靠我	ACME，affy，affyPLM，altcdfenvs，amplican，AnnotationDbi，AnnotationForge，AnnotationHub，ATACseqQC，beadarray，bioassayR，Biobase，Biostrings，bnbc，BSgenome，bsseq，红衣主教，类别，categoryCompare，ChAMPdata，chipseq，ChIPseqR，ChromHeatMap，cleanUpdTSeq，clusterExperiment，codelink，consensusDE，consensusSeekeR，copynumber，CRISPRseek，腰带，DelayedArray，DESeq，dexus，ensembldb，ensemblVEP，ExperimentHub，ExperimentHubData，GDSArray，geneplotter，GenomeInfoDb，genomeIntervals，GenomicAlignments，GenomicFeatures，GenomicFiles，GenomicRanges，GenomicScores，genoset，ggbio，girafe，图，GSEABase，GUIDEseq，HelloRanges，interactiveDisplay，interactiveDisplayBase，IRanges，liftOver，工商管理硕士，MeSHDbi，methyAnalysis，MIGSA，MineICA，minfi，MLInterfaces，MotifDb，MotIV，mpra，MSnbase，乘，NADfinder，ngsReports，益生元，OrganismDbi，pandaR，plethy，plyranges，PoTRA，profileplyr，PSICQUIC，PWMEnrich，QSutils，RareVariantVis，REDseq，Repitools，RNAprobR，RnBeads，战，rsbml，S4Vectors，scsR，shinyMethyl，ShortRead，simpleaffy，simplifyEnrichment，simulatorZ，soGGi，spqn，StructuralVariantAnnotation，SummarizedBenchmark，TEQC，tigre，topdownr，topGO，撤销，UniProt.ws，VanillaICE，VariantAnnotation，VariantFiltering，VCFArray，XVector，山药
进口我	a4Preproc，affycoretools，affylmGUI，AllelicImbalance，AneuFinder，annmap，注释，AnnotationHubData，ArrayExpressHTS，ASpli，AUCell，bambu，bamsignals，基础知识，后面;，beachmat，bigmelon，biocGraph，BiocIO，BiocSingular，biotmle，biovizBase，biscuiteer，BiSeq，blima，breakpointR，BrowserViz，BSgenome，BubbleTree，bumphunter，BUSpaRse，CAGEfightR，篮球选手，卡斯珀，celaref，CellaRepertorium，cellHTS2，CellMixS，CellTrails，cgdv17，cghMCR，ChemmineDrugs，ChemmineOB，ChemmineR，别致的，ChIPComp，chipenrich，chipenrich.data，ChIPpeakAnno，ChIPQC，ChIPseeker，chipseq，ChIPSeqSpike，chromstaR，chromVAR，西塞罗，clusterSeq，cn.mops，cn，CNVPanelizer，CNVRanger，可可，可乐，compEpiTools，contiBAIT，CoreGx，crlmm，crossmeta，csaw，ctgGEM，腰带，curatedCRCData，curatedOvarianData，cydar，dada2，dagLogo，DAMEfinder，ddCt，decompTumor2Sig，DEGreport，DelayedDataFrame，derfinder，DEScan2，DESeq2，命运，DEWSeq，DEXSeq，diffcoexp，diffHic，DirichletMultinomial，DiscoRhythm，DRIMSeq，DropletUtils，DrugVsDisease，easyRNASeq，EBImage，EDASeq，eiR，eisa，eisaR，enrichTF，epigenomix，EpiTxDb，epivizrChart，epivizrStandalone，erma，esATAC，FamAgg，fastseg，ffpe，FindMyFriends，flowBin，flowClust，flowCore，flowFP，FlowSOM，flowSpecs，flowStats，flowWorkspace，fmcsR，弗雷泽，frma，FunciSNP，GA4GHclient，GA4GHshiny，gcapc，genbankr，geneAttribution，geneClassifiers，genefilter，《创世纪》，GenomicAlignments，GenomicInteractions，GenomicTuples，genotypeeval，GenVisR，GGBase，GGtools，gmapR，gmoviz，goseq，哥特，gpuMagic，gQTLBase，gQTLstats，GSVA，Gviz，HDF5Array，的热图，希尔达，hiReadsProcessor，hopach，HTSeqGenie，icetea，igvR，IHW，IHWpaper，ima，infercnv，检查，InTAD，intansv，InteractionSet，感兴趣，电离，iSEE，IsoformSwitchAnalyzeR，isomiRs，iva，JunctionSeq，KCsmart，KEGGandMetacoreDzPathwaysGEO，KEGGdzPathwaysGEO，ldblock，萝拉，微波激射器，桅杆，事，餐，meshr，metaMS，metaseqR2，methInheritSim，MethylAid，methylPipe，methylumi，methyvim，mimager，MinimumDistance，米拉，海市蜃楼，missMethyl，MMAPPR2，Modstrings，mogsa，单片眼镜，motifbreakR，MouseGastrulationData，msa，MSnID，MultiAssayExperiment，multicrispr，MultiDataSet，multiMiR，MutationalPatterns，mzR，NarrowPeaks，ncdfFlow，nearBynding，npGSEA，诊断，oligoClasses，OmicsLonDA，openCyto，openPrimeR，ORFik，先驱者，parglms，PathwaySplice，pcaMethods，pdInfoBuilder，phemd，phyloseq，π，钢琴，平，赢钱，podkat，普拉达，婴儿车，primirTSS，proDA，profileScoreDist，pRoloc，pRolocGUI，PureCN，pwOmics，QFeatures，qPLEXanalyzer，qsea，QuasR，R3CPET，R453Plus1Toolbox，RaggedExperiment，ramwas，Rariant，美国广播公司，RcisTarget，RCy3，RCyjs，收回，REMP，ReportingTools，RGalaxy，RGMQL，RGSEA，RiboProfiling，ribosomeProfilingQC，林格，RJMCMCNucleosomes，rnaEditr，RNAmodR，RNAmodR。AlkAnilineSeq，RNAmodR。毫升，RNAmodR。RiboMethSeq，咆哮，的方式，Rqc，rqubic，Rsamtools，rsbml，rScudo，RTCGAToolbox，rtracklayer，SC3，嘘，scDblFinder，scmap，SCnorm，范围，scPipe，食物，scRNAseq，颈背，天窗，SeqVarTools，sevenC，SGSeq，SharedObject，签名者，simpleaffy，SingleCellExperiment，SingleCellMultiModal，singleCellTK，SLGI，SNPhood，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP149.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP150.GRCh38，SNPlocs.Hsapiens.dbSNP151.GRCh38，snpStats，spicyR，飞溅，SplicingGraphs，SQLDataFrame，sRACIPE，sscu，斯坦，strandCheckR，彩带，Structstrings，SummarizedExperiment，SynMut，systemPipeRdata，TAPseq，目标，TarSeqQC，TCGAutils，TCseq，TENxBUSData，TFBSTools，TitanCNA，trackViewer，transcriptR，石棉水泥板，TransView，TreeSummarizedExperiment，tRNA，tRNAdbImport，tRNAscanImport，TSRchitect，TVTB，Ularcirc，unifiedWMWqPCR，universalmotif，的作用，VariantTools，VariantToolsData，伶盗龙，wavClusteR，weitrix，xcms，XDE，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh37，XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38，XVector
建议我	acde，aggregateBioVar，目标，ArrayTV，资产，BaalChIP，baySeq，BDMMAcorrect，bigmelon，bigmemoryExtras，bigPint，BiocCheck，BiocParallel，BiocStyle，biocViews，BioMM，biosigner，BiRewire，BLMA，BUScorrect，咖啡馆，相机，CancerSubtypes，萤石，CausalR，ccrepe，CellNOptR，CexoR，ChIPanalyser，ChIPXpress，CHRONOS，CINdex，限幅器，clonotypeR，clustComp，CNORfeeder，CNORfuzzy，coexnet，彗星，ConnectivityMap，共识，cosmiq，COSNet，cpvSNP，CytoTree，DAPAR，DBChIP，DEsubs，DMRcaller，DMRcate，ENCODExplorer，ENCODExplorerData，EnhancedVolcano，ENmix，epiNEM，EventPointer，fCCAC，fcScan，FGNet，FieldEffectCrc，flowCL，flowCut，FlowRepositoryR，flowSpy，flowTime，核磁共振，focalCall，GateFinder，gCrisprTools，gdsfmt，宝石，GeneNetworkBuilder，GeneOverlap，geneplast，geneRxCluster，geNetClassifier，genomation，GEOquery，GMRP，GOstats，GraphPAC，GreyListChIP，grndata，GWASTools，h5vc，哈曼，HarmanData，hiAnnotator，hierGWAS，HIREewas，超图，iCARE，iClusterPlus，illuminaio，InPAS，INPower，首次公开募股，烤肉串，KEGGREST，花边，林肯，LRBase.Ath.eg.db，LRBase.Bta.eg.db，LRBase.Cel.eg.db，LRBase.Dme.eg.db，LRBase.Dre.eg.db，LRBase.Gga.eg.db，LRBase.Hsa.eg.db，LRBase.Mmu.eg.db，LRBase.Pab.eg.db，LRBase.Rno.eg.db，LRBase.Ssc.eg.db，LRBase.Xtr.eg.db，LRBaseDbi，mAPKL，massiR，MatrixRider，mbt，mCSEA，mdgsa，Mergeomics，MeSH.Aca.eg.db，MeSH.Aga.PEST.eg.db，MeSH.Ame.eg.db，MeSH.Aml.eg.db，MeSH.Ana.eg.db，MeSH.Ani.FGSC.eg.db，MeSH.AOR.db，MeSH.Ath.eg.db，MeSH.Bfl.eg.db，MeSH.Bsu.168.eg.db，MeSH.Bta.eg.db，MeSH.Cal.SC5314.eg.db，MeSH.Cbr.eg.db，MeSH.Cel.eg.db，MeSH.Cfa.eg.db，MeSH.Cin.eg.db，MeSH.Cja.eg.db，MeSH.Cpo.eg.db，MeSH.Cre.eg.db，MeSH.Dan.eg.db，MeSH.db，MeSH.Dda.3937.eg.db，MeSH.Ddi.AX4.eg.db，MeSH.Der.eg.db，MeSH.Dgr.eg.db，MeSH.Dme.eg.db，MeSH.Dmo.eg.db，MeSH.Dpe.eg.db，MeSH.Dre.eg.db，MeSH.Dse.eg.db，MeSH.Dsi.eg.db，MeSH.Dvi.eg.db，MeSH.Dya.eg.db，MeSH.Eca.eg.db，MeSH.Eco.55989.eg.db，MeSH.Eco.ED1a.eg.db，MeSH.Eco.IAI39.eg.db，MeSH.Eco.K12.MG1655.eg.db，MeSH.Eco.O157.H7.Sakai.eg.db，MeSH.Eco.UMN026.eg.db，MeSH.Eqc.eg.db，MeSH.Gga.eg.db，MeSH.Gma.eg.db，MeSH.Hsa.eg.db，MeSH.Laf.eg.db，MeSH.Lma.eg.db，MeSH.Mdo.eg.db，MeSH.Mes.eg.db，MeSH.Mga.eg.db，MeSH.Miy.eg.db，MeSH.Mml.eg.db，MeSH.Mmu.eg.db，MeSH.Mtr.eg.db，MeSH.Nle.eg.db，MeSH.Oan.eg.db，MeSH.Ocu.eg.db，MeSH.Oni.eg.db，MeSH.Osa.eg.db，MeSH.Pab.eg.db，MeSH.Pae.PAO1.eg.db，MeSH.PCR.db，MeSH.Pfa.3D7.eg.db，MeSH.Pto.eg.db，MeSH.Ptr.eg.db，MeSH.Rno.eg.db，MeSH.Sce.S288c.eg.db，MeSH.Sco.A32.eg.db，MeSH.Sil.eg.db，MeSH.Spu.eg.db，MeSH.Ssc.eg.db，MeSH.Syn.eg.db，MeSH.Tbr.9274.eg.db，MeSH.Tgo.ME49.eg.db，MeSH.Tgu.eg.db，MeSH.Vvi.eg.db，MeSH.Xla.eg.db，MeSH.Xtr.eg.db，MeSH.Zma.eg.db，金属底座，MetaboSignal，metagene，metagene2，metagenomeSeq，metaseqR，MetCirc，methylCC，methylInheritance，MetNet，微生物组，microRNAome，MIGSAdata，miRBaseConverter，miRcomp，mirIntegrator，miRLAB，Mirsynergy，mnem，motifStack，MSEADbi，multiClust，MultiMed，multiOmicsViz，MWASTools，NBSplice，ncRNAtools，netbenchmark，netbiov，NetSAM，nondetects，NoRCE，nucleoSim，OMICsPCA，OncoScore，PAA，panelcn.mops，Path2PPI，PathNet，pathview，PCAtools，pepXMLTab，PGA，PharmacoGx，PhenStat，powerTCR，奖，proBAMr，proFIA，pwrEWAS，pwrEWAS.data，qpgraph，quantro，QuartPAC，RBGL，rBiopaxParser，Rcade，rcellminer，rCGH，Rcpi，REBET，RegParallel，rfaRm，RGraph2js，Rgraphviz，rgsepd，riboSeqR，ROntoTools，ropls，ROSeq，研制，RTNduals，RTNsurvival，rTRM，SAIGEgds，samExploreR，sangerseqR，sapFinder，衬衣，scDataviz，scmeth，用水晶球占卜，segmentSeq，SeqArray，seqPattern，seqTools，sesameData，SICtools，sigFeature，sigsquared，SIMAT，similaRpeak，SIMLR，单，弹弓，SNPRelate，寄居，SpacePAC，sparseDOSSA，SparseSignatures，spatialHeatmap，specL，STATegRa，STRINGdb，systemPipeR，移行细胞癌，TFEA。芯片，锡，transcriptogramer，tra利用，TreeAndLeaf，trena，TRONCO，Uniquorn，variancePartition，左页
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BiocGenerics_0.36.1.tar.gz
Windows二进制	BiocGenerics_0.36.1.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BiocGenerics_0.36.1.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocGenerics
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BiocGenerics
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BiocGenerics/
软件包下载报告	下载数据