BiocCheck

DOI:10.18129 / B9.bioc.BiocCheck

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅BiocCheck

Bioconductor-specific包检查

Bioconductor版本:3.12

执行Bioconductor-specific包检查。

作者:Bioconductor包维护者(aut (cre), Lori牧羊人(aut),丹尼尔·冯·Twisk[所有],凯文街(施),马塞尔•拉莫斯(施),莱昂纳多Collado-Torres[所有],费德里科•马里尼(施)

维修工:Bioconductor包维护者<维护者bioconductor.org >

从内部引用(R,回车引用(“BiocCheck”)):

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“BiocCheck”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“BiocCheck”)

HTML R脚本 BiocCheck:确保Bioconductor方案的指导方针
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 基础设施,软件
版本 1.26.0
Bioconductor自 BioC 2.14 (r - 3.1)(7年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (> = 3.5.0)
进口 biocViews(> = 1.33.7),BiocManager,stringdist,,httr、工具、optparse,codetools、方法、跑龙套knitr
链接
建议 RUnit,BiocGenerics,Biobase,RJSONIO,rmarkdown,devtools(> = 1.4.1),usethis,BiocStyle
SystemRequirements
增强了 codetoolsBioC
URL https://github.com/Bioconductor/BiocCheck/issues
取决于我
进口我 ExperimentHubData
建议我 curatedMetagenomicData,HMP16SData,HMP2Data,packFinder,preciseTAD,SpectralTAD
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包 BiocCheck_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 BiocCheck_1.26.0.zip
macOS 10.13(高山脉) BiocCheck_1.26.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BiocCheck
源库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ BiocCheck
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BiocCheck/
包下载报告 下载数据

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  • 支持网站——关于Bioconductor包的问题
  • 正常词 开发人员邮件列表,包bob电竞体育官网