BioMM

DOI:10.18129 / B9.bioc.BioMM

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见BioMM．

BioMM:使用组学数据进行表型预测的生物知情多阶段机器学习框架

Bioconductor版本:3.12

从高维组学数据中识别可重复的生物模式是理解复杂疾病或性状的生物学的关键因素。将现有的生物学知识整合到机器学习中是推进此类研究的重要一步。我们提出了一个生物信息的多阶段机器学习框架，称为BioMM，专门用于基于组学尺度数据的表型预测，我们可以使用先验生物元信息评估不同的机器学习模型。

作者:陈俊芳，Emanuel Schwarz

维护者:Junfang Chen < Junfang。陈33在gmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("BioMM")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“BioMM”)

超文本标记语言	R脚本	BioMMtutorial
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	分类，去，遗传学，通路，回归，软件
版本	1.6.0
在Bioconductor	BioC 3.9 (R-3.6)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6)
进口	stats, utils, grDevices，晶格，BiocParallel，glmnet，rms，precrec，nsprcomp，管理员，e1071，ggplot2，vioplot，CMplot，成像仪，topGO，xlsx
链接
建议	BiocStyle，knitr，RUnit，BiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	BioMM_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	BioMM_1.6.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	BioMM_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BioMM
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BioMM
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/BioMM/
软件包下载报告	下载数据