生物剂

doi:10.18129/b9.bioc.biocor

该包适用于生物导体的3.12版;对于稳定的最新版本,请参阅生物剂

功能相似性

生物导体版本:3.12

根据KEGG和Reactome或基因集中描述的途径计算功能相似性。这些相似性可以针对途径或基因集,基因或簇计算,并与其他相似性相结合。它们可用于改善网络,基因选择,测试关系...

作者:LluísRevillaSancho [AUT,CRE],pau sancho-bru [ths],胡安·何塞·萨尔瓦特拉·洛扎诺[THS]

维护者:lluísRevillasancho

引用(从r内,输入引用(“生物量”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ biocor”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

Browsevignettes(“ Biocor”)

html R脚本 关于生物剂
html R脚本 生物器的高级用法
PDF 参考手册
文本 消息
文本 执照

细节

生物浏览 聚类,,,,基因表达,,,,网络,,,,NetworkEnrichment,,,,途径,,,,软件,,,,统计信息,,,,系统生物学
版本 1.14.0
在生物导体中 Bioc 3.5(R-3.4)(4年)
执照 麻省理工学院 +文件执照
要看 R(> = 3.4.0)
进口 生物比较,,,,矩阵, 方法,gseabase
链接
建议 Reactome.db,,,,org.hs.eg.db,,,,WGCNA,,,,Gosemsim,,,,测试,,,,尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,呼吸道,,,,deseq2,,,,引导,,,,targetscan.hs.eg.db,,,,HMISC,,,,拼写
系统要求
增强
URL https://llrs.github.io/biocor/
BugReports https://github.com/llrs/biocor/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随bob 体育网址 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 Biocor_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 Biocor_1.14.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) Biocor_1.14.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/biocor
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:包装/生物仪
包装短URL //www.anjoumacpherson.com/packages/biocor/
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