BPRMeth

DOI:10.18129 / B9.bioc.BPRMeth

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见BPRMeth

建模高阶甲基化剖面

Bioconductor版本:3.12

BPRMeth包是一种量化甲基化谱显式特征的概率方法,在某种程度上可以更容易地在下游建模工作中正式使用这些谱,例如预测基因表达水平或根据甲基化谱聚类基因组区域或细胞。

作者:Chantriolnt-Andreas Kapourani [aut, cre]

维护者:Chantriolnt-Andreas Kapourani

引文(从R内,输入引用(“BPRMeth”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("BPRMeth")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“BPRMeth”)

超文本标记语言 R脚本 BPRMeth:模拟高阶甲基化剖面
PDF 参考手册
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文本 许可证

细节

biocViews 贝叶斯聚类报道DNAMethylation表观遗传学FeatureExtractionGeneExpressionGeneRegulation遗传学ImmunoOncologyKEGGRNASeq回归测序SingleCell软件
版本 1.16.0
在Bioconductor BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证 GPL-3 |文件许可证
取决于 R (>= 3.5.0),GenomicRanges
进口 为了、方法、质量doParallel平行,e1071地球foreachrandomForest统计数据,IRangesS4Vectorsdata.table、图形、truncnormmvtnormRcpp(> = 0.12.14),matrixcalcmagrittrkernlabggplot2cowplotBiocStyle
链接 RcppRcppArmadillo
建议 testthatknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 梅丽莎
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构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 BPRMeth_1.16.0.tar.gz
Windows二进制 BPRMeth_1.16.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra) BPRMeth_1.16.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/BPRMeth
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/BPRMeth
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/BPRMeth/
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