AssessORF

DOI:10.18129 / B9.bioc.AssessORF

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见AssessORF

利用蛋白质组学和进化保护评估基因预测

Bioconductor版本:3.12

为了评估基因组的一组预测基因的质量,必须首先将证据映射到该基因组。接下来,每个基因必须根据支持或反对该基因的证据有多强来分类。AssessORF包提供完成这些任务所必需的功能和类结构,使用蛋白质组命中和进化保守的开始密码子作为证据形式。

作者:Deepank Korandla [aut, cre], Erik Wright [aut]

维护者:Deepank Korandla

引文(从R内,输入引用(“AssessORF”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

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文档

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browseVignettes(“AssessORF”)

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文本 新闻

细节

biocViews ComparativeGenomicsGenePrediction遗传学GenomeAnnotation蛋白质组学质量控制软件可视化
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.5.0),解读(> = 2.10.0)
进口 BiostringsGenomicRangesIRanges,图形,grDevices,方法,统计,utils
链接
建议 AssessORFDataBiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
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包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 AssessORF_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 AssessORF_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) AssessORF_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AssessORF
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AssessORF
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AssessORF/
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