ArrayExpress

DOI:10.18129 / B9.bioc.ArrayExpress

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见ArrayExpress

在EBI访问ArrayExpress Microarray数据库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

Bioconductor版本:3.12

访问EBI的ArrayExpress存储库并构建Bioconductor数据结构:ExpressionSet, AffyBatch, NChannelSet

作者:奥黛丽·考夫曼,易卜拉欣·伊玛姆,迈克尔·舒伯特

维护者:Suhaib Mohammed < Suhaib at ebi.ac.uk>

引文(从R内,输入引用(“ArrayExpress”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“ArrayExpress”)

PDF R脚本 ArrayExpress:将ArrayExpress数据集导入并转换为R对象
PDF 参考手册

细节

biocViews DataImport微阵列OneChannel软件TwoChannel
版本 1.50.0
在Bioconductor BioC 2.3 (R-2.8)(12.5年)
许可证 艺术- 2.0
取决于 R (>= 2.9.0),Biobase(> =测试盒框)
进口 XML益生元limma
链接
建议 affy
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我 DrugVsDiseasemaEndToEnd
进口我
建议我 Hiiragi2013
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 ArrayExpress_1.50.0.tar.gz
Windows二进制 ArrayExpress_1.50.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) ArrayExpress_1.50.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ArrayExpress
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ArrayExpress
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/ArrayExpress/
软件包下载报告 下载数据

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Bioconductor

R/凹口包和文档

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  • 支持网站-询问有关Bioconductor封装的问题
  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网