AffiXcan

DOI:10.18129 / B9.bioc.AffiXcan

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本,请参见AffiXcan

遗传调控表达的功能方法

Bioconductor版本:3.12

利用基于总结合亲和力(TBA)的方法,为个体样本中的一组基因输入一个GReX(基因调控表达)。输入GReX的统计模型可以用一个已知真实总表达式值的训练数据集进行训练。

作者:Alessandro Lussana [aut, cre]

维护者:Alessandro Lussana < Alessandro。Lussana在protonmail.com>

引文(从R内,输入引用(“AffiXcan”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("AffiXcan")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“AffiXcan”)

超文本标记语言 R脚本 AffiXcan
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews DimensionReductionGeneExpressionGeneRegulationPrincipalComponent回归软件转录
版本 1.8.0
在Bioconductor BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年)
许可证 GPL-3
取决于 R (>= 3.6),SummarizedExperiment
进口 MultiAssayExperimentBiocParallel蜡笔
链接
建议 BiocStyleknitrrmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 AffiXcan_1.8.0.tar.gz
Windows二进制 AffiXcan_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra) AffiXcan_1.8.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffiXcan
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AffiXcan
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/AffiXcan/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网