AffiXcan

DOI:10.18129 / B9.bioc.AffiXcan

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见AffiXcan．

遗传调控表达的功能方法

Bioconductor版本:3.12

利用基于总结合亲和力(TBA)的方法，为个体样本中的一组基因输入一个GReX(基因调控表达)。输入GReX的统计模型可以用一个已知真实总表达式值的训练数据集进行训练。

作者:Alessandro Lussana [aut, cre]

维护者:Alessandro Lussana < Alessandro。Lussana在protonmail.com>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")::install("AffiXcan")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“AffiXcan”)

超文本标记语言	R脚本	AffiXcan
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DimensionReduction，GeneExpression，GeneRegulation，PrincipalComponent，回归，软件，转录
版本	1.8.0
在Bioconductor	BioC 3.8 (R-3.5)(2.5年)
许可证	GPL-3
取决于	R (>= 3.6)，SummarizedExperiment
进口	MultiAssayExperiment，BiocParallel，蜡笔
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	AffiXcan_1.8.0.tar.gz
Windows二进制	AffiXcan_1.8.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	AffiXcan_1.8.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AffiXcan
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AffiXcan
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AffiXcan/
软件包下载报告	下载数据