AMOUNTAIN

DOI:10.18129 / B9.bioc.AMOUNTAIN

此包适用于Bioconductor 3.12版本;有关稳定的最新发布版本，请参见AMOUNTAIN．

多层加权基因共表达网络的有源模块:一种持续优化方法

Bioconductor版本:3.12

一个纯数据驱动的基因网络，即加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network, WGCN)可以仅从表达谱构建。这种网络中的不同层可能代表不同的时间点、多个条件或不同的物种。AMOUNTAIN的目标是在多层WGCN中使用连续优化方法搜索活动模块。

作者:李东，何珊，潘志松，胡谷玉

维护者:董力

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("AMOUNTAIN")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“AMOUNTAIN”)

超文本标记语言	R脚本	装饰图案的标题
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	DifferentialExpression，GeneExpression，微阵列，网络，软件
版本	1.16.0
在Bioconductor	BioC 3.4 (R-3.3)(4.5年)
许可证	GPL (>= 2)
取决于	R (>= 3.3.0)
进口	统计数据
链接
建议	BiocStyle，qgraph，knitr，rmarkdown
SystemRequirements	gsl
增强了
URL
全靠我
进口我	这种款式
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	AMOUNTAIN_1.16.0.tar.gz
Windows二进制	AMOUNTAIN_1.16.0.zip(32位和64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	AMOUNTAIN_1.16.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/AMOUNTAIN
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/AMOUNTAIN
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/AMOUNTAIN/
软件包下载报告	下载数据