ADAMgui

DOI:10.18129 / B9.bioc.ADAMgui

这个包是3.12版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅ADAMgui。

活动和多样性分析模块的图形用户界面

Bioconductor版本:3.12

ADAMgui亚当是一个图形用户界面的包。ADAMgui包提供2 shiny-based应用程序允许用户研究亚当包文件的输出通过不同的情节。这是有可能的,例如,选择一个特定的GFAG和观察基因表达行为GFAGtargetUi函数创建的情节。特性,比如微分表达式和foldchange可以很容易地看到与援助的情节由GFAGpathUi函数。

作者:布鲁诺Sanches <佐丹奴入股事宜。在unesp布鲁诺。br >,安德烈·路易斯Molan <安德烈。molan unesp。br >,艾格尼丝·亚历山德拉Sekijima武田<艾格尼丝。在unesp武田。br >何塞•路易斯Rybarczyk球场<何塞。路易斯在unesp.br >

维护人员:何塞•路易斯Rybarczyk球场<何塞。路易斯在unesp.br >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“ADAMgui”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:

browseVignettes (“ADAMgui”)

HTML	R脚本	使用ADAMgui
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	GeneSetEnrichment,KEGG,通路,软件
版本	1.6.0
Bioconductor自	BioC 3.9 (r - 3.6)(2年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R(> = 3.6),统计,跑龙套,方法,亚当
进口	GO.db(> = 3.5.0),dplyr(> = 0.7.6),闪亮的(> = 1.1.0),stringr(> = 1.3.1),stringi(> = 4),varhandle(> = 2.0.3),ggplot2(> = 3.0.0),ggrepel(> = 0.8.0),ggpubr(> = 0.1.8),ggsignif(> = 0.4.0),reshape2(> = 3),RColorBrewer(> = 1.1 - 2),colorRamps(> = 2.3),DT(> = 0.4),data.table(> = 1.11.4),gridExtra(> = 2.3),shinyjs(> = 1.0),knitr,testthat
链接
建议	BiocStyle
SystemRequirements
增强了
URL	稍后通知
BugReports	https://github.com/jrybarczyk/ADAMgui/issues
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	ADAMgui_1.6.0.tar.gz
Windows二进制	ADAMgui_1.6.0.zip
macOS 10.13(高山脉)	ADAMgui_1.6.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ADAMgui
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ ADAMgui
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/ADAMgui/
包下载报告	下载数据