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tximportData
DOI:10.18129 / B9.bioc.tximportData
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅tximportData。
tximportData
Bioconductor版本:3.11
这个包提供了运行的输出各种记录丰富的量词在一组6 RNA-seq样本GEUVADIS项目。量词是袖扣,RSEM kallisto,鲑鱼和旗鱼。有关版本号、样品信息,详情电话,看到包的装饰图案。
作者:迈克尔的爱
维修工:迈克尔爱< michaelisaiahlove gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“tximportData”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“tximportData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“tximportData”)
| HTML | R脚本 | 为tximport示例输出文件 |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ExperimentData,RNASeqData,SequencingData |
| 版本 | 1.16.0 |
| 许可证 | GPL (> = 2) |
| 取决于 | |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | DESeq2,HumanTranscriptomeCompendium,tximeta,tximport,variancePartition |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | tximportData_1.16.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tximportData |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ tximportData |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/tximportData/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
