spatialLIBD

DOI:10.18129 / B9.bioc.spatialLIBD

这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅spatialLIBD。

检查员LIBD Visium空间人类飞行员转录组数据

Bioconductor版本:3.11

检查交互空间转录组10倍基因组Visium数据从梅纳德Collado-Torres et al, 2020分析了利大脑发展研究所研究人员和合作者。

作者:达芬奇Collado-Torres (aut (cre),克里斯汀·r·梅纳德(施)安德鲁·e·贾菲(施)

维护人员:达芬奇Collado-Torres < lcolladotor gmail.com >

安装

安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“spatialLIBD”)

R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。

文档

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browseVignettes (“spatialLIBD”)

HTML	R脚本	介绍spatialLIBD
PDF		参考手册
文本		新闻

细节

biocViews	ExperimentData,ExperimentHub,ExpressionData,Homo_sapiens_Data,PackageTypeData,SequencingData,SingleCellData,组织
版本	1.0.0
许可证	艺术- 2.0
取决于	SingleCellExperimentR (> = 3.6)
进口	闪亮的,傀儡,ggplot2,cowplot,情节,viridisLite,shinyWidgets,彩色,sessioninfo、网格grDevices、方法AnnotationHub跑龙套,png,嘘,DT,ExperimentHub,RColorBrewer,SummarizedExperiment、统计数据、图表、S4Vectors,IRanges,字段,benchmarkme
链接
建议	knitr,rmarkdown,BiocStyleknitcitations,testthat(> =魅惑,covr,在这里,BiocManager
SystemRequirements
增强了
URL	https://github.com/LieberInstitute/spatialLIBD
BugReports	https://support.bioconductor.org/t/spatialLIBD
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包档案

遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。

源包	spatialLIBD_1.0.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13(高山脉)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spatialLIBD
源库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ spatialLIBD
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/spatialLIBD/
包下载报告	下载数据