rcellminerData

DOI:10.18129 / B9.bioc.rcellminerData

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本，请参见rcellminerData．

rcellminerData: NCI-60细胞系的分子特征和药物反应

Bioconductor版本:3.11

几十年来，NCI-60癌细胞系面板一直被用作抗癌药物筛选。该小组是作为美国国家癌症研究所(NCI)的发育治疗计划(DTP, http://dtp.nci.nih.gov/)的一部分而开发的。在NCI-60上已经测试了数千种化合物，这些化合物已被许多平台广泛表征，包括基因和蛋白质表达、拷贝数、突变等(Reinhold, et al.， 2012)。CellMiner项目(http://discover.nci.nih.gov/ CellMiner)的目的是整合用于分析NCI-60的多个平台的数据，并为探索NCI-60数据提供一套强大的工具。

作者:Augustin Luna, Vinodh Rajapakse, Fabricio Sousa

维护者:Augustin Luna ， Vinodh Rajapakse < Vinodh。rajapakse at nih.gov>， Fathi Elloumi < Fathi。Elloumi在nih.gov>报道

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("rcellminerData")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“rcellminerData”)

超文本标记语言	R脚本	访问CellMiner数据
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	CancerData，CopyNumberVariationData，ExperimentData，ExpressionData，MicroarrayData，NCI，SNPData，miRNAData
版本	2.10.2
许可证	LGPL-3 +文件许可证
取决于	R (>= 3.1.1)，Biobase
进口
链接
建议	knitr，testthat，BiocStyle，rcellminer
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我	rcellminer
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包	rcellminerData_2.10.2.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rcellminerData
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rcellminerData
包短Url	//www.anjoumacpherson.com/packages/rcellminerData/
软件包下载报告	下载数据