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pathprintGEOData
DOI:10.18129 / B9.bioc.pathprintGEOData
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅pathprintGEOData。
通路指纹向量代表一个分段的数组地理数据存储库
Bioconductor版本:3.11
通路指纹向量已经预计算~ 390000公开数组从GEO语料库,横跨6种和31个平台。所有数据都伴随着相关的元数据。
作者:Gabriel Altschuler Sokratis Kariotis
维护人员:Sokratis Kariotis < s。在sheffield.ac.uk kariotis >
从内部引用(R,回车引用(“pathprintGEOData”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“pathprintGEOData”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes (“pathprintGEOData”)
| R脚本 | pathprintGEOData | |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | Caenorhabditis_elegans_Data,Danio_rerio_Data,Drosophila_melanogaster_Data,ExperimentData,ExpressionData,地理,基因组,Homo_sapiens_Data,MicroarrayData,Mus_musculus_Data,OneChannelData,PathwayInteractionDatabase,Rattus_norvegicus_Data,SequencingData,TwoChannelData |
| 版本 | 1.18.0 |
| 许可证 | GPL |
| 取决于 | R (> = 3.4) |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | pathprint,SummarizedExperiment |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | pathprint |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | pathprintGEOData_1.18.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/pathprintGEOData |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/ pathprintGEOData |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/pathprintGEOData/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
