此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见msd16s。
Bioconductor版本:3.11
来自992例健康和中至重度腹泻样本的肠道16S测序表达数据用于“低收入国家幼儿腹泻导致肠道微生物群组成的大规模改变”。
作者:Joseph N. Paulson, Hector Corrada Bravo, Mihai Pop
维护者:Joseph N. Paulson
引文(从R内,输入引用(“msd16s”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("msd16s")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放。
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“msd16s”)
R脚本 | msd16s | |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | ExperimentData,MicrobiomeData,SequencingData |
版本 | 1.8.0 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | R (>= 2.10),Biobase,metagenomeSeq |
进口 | |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | http://www.cbcb.umd.edu/research/projects/GEMS-pathogen-discovery |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | metavizr |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | msd16s_1.8.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/msd16s |
源存储库(开发人员访问) | Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/msd16s |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/msd16s/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |