裂变
DOI:10.18129 / B9.bioc.fission
这个包是3.11版本Bioconductor;的稳定,最新的发布版本,请参阅裂变。
RangedSummarizedExperiment时间课程RNA-Seq裂殖酵母,以应对压力,由梁et al ., Nat Commun 2014。
Bioconductor版本:3.11
这个包提供了一个RangedSummarizedExperiment对象阅读数量基因的一段时间课程RNA-Seq实验裂殖酵母(粟酒裂殖酵母)的氧化应激反应(1米山梨糖醇治疗)(0)15、30、60、120和180分钟。样品都进一步划分为野生型组和一组atf21删除。阅读数矩阵研究的准备和提供的作者:梁HS,道森K, Wirth C,李Y, Connolly Y,史密斯DL,威尔金森CR,米勒CJ。“一个全球非编码RNA系统调节裂殖酵母蛋白质水平对压力的反应”。Nat Commun 2014年5月23日,5:3947。PMID: 24853205。地理:GSE56761。
作者:迈克尔的爱
维修工:迈克尔爱< michaelisaiahlove gmail.com >
从内部引用(R,回车引用(“裂变”)):
安装
安装这个包,开始R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace (“BiocManager”,悄悄地= TRUE)) install.packages (“BiocManager”) BiocManager::安装(“裂变”)
R的旧版本,请参考适当的Bioconductor释放。
文档
查看文档的版本这个包安装在您的系统,开始R和输入:
browseVignettes(“裂变”)
| HTML | R脚本 | 裂殖酵母时间进程 |
| 参考手册 |
细节
| biocViews | ExperimentData,地理,基因组,RNASeqData,Saccharomyces_cerevisiae_Data,SequencingData |
| 版本 | 1.8.0 |
| 许可证 | LGPL |
| 取决于 | R (> = 2.10),SummarizedExperiment |
| 进口 | |
| 链接 | |
| 建议 | knitr |
| SystemRequirements | |
| 增强了 | |
| URL | |
| 取决于我 | rnaseqGene,ROCpAI |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 我的链接 | |
| 构建报告 |
包档案
遵循bob 体育网址 指示在R会话中使用这个包。
| 源包 | fission_1.8.0.tar.gz |
| Windows二进制 | |
| macOS 10.13(高山脉) | |
| 源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fission |
| 源库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:包/裂变 |
| 包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/fission/ |
| 包下载报告 | 下载数据 |
