此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RTCGA.mutations.
Bioconductor版本:3.11
Package提供来自癌症基因组图谱项目的所有队列类型的突变数据集,来自http://gdac.broadinstitute.org/。突变数据格式在这里解释https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/Mutation+Annotation+Format+(MAF)+Specification。另外还有一栏是病人的条形码。2015-11-01快照数据。
作者:Marcin Kosinski
维护者:Marcin Kosinski
引文(从R内,输入引用(“RTCGA.mutations”)
):
要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")
对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放.
要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:
browseVignettes(“RTCGA.mutations”)
超文本标记语言 | R脚本 | 使用RTCGA下载包含在RTCGA.mutations中的突变数据 |
参考手册 | ||
文本 | 新闻 |
biocViews | 注释数据,ExperimentData |
版本 | 20151101.18.0 |
许可证 | GPL-2 |
取决于 | R (>= 3.2.0),RTCGA |
进口 | |
链接 | |
建议 | knitr |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
BugReports | https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues |
全靠我 | |
进口我 | |
建议我 | RTCGA |
链接到我 | |
构建报告 |
遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。
源包 | RTCGA.mutations_20151101.18.0.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
源库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RTCGA.mutations |
源存储库(开发人员访问) | git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RTCGA.mutations |
包短Url | //www.anjoumacpherson.com/packages/RTCGA.mutations/ |
软件包下载报告 | 下载数据 |