RTCGA.mutations

DOI:10.18129 / B9.bioc.RTCGA.mutations

此包适用于Bioconductor 3.11版本;有关稳定的最新发布版本,请参见RTCGA.mutations

来自癌症基因组图谱计划的突变数据集

Bioconductor版本:3.11

Package提供来自癌症基因组图谱项目的所有队列类型的突变数据集,来自http://gdac.broadinstitute.org/。突变数据格式在这里解释https://wiki.nci.nih.gov/display/TCGA/Mutation+Annotation+Format+(MAF)+Specification。另外还有一栏是病人的条形码。2015-11-01快照数据。

作者:Marcin Kosinski

维护者:Marcin Kosinski

引文(从R内,输入引用(“RTCGA.mutations”)):

安装

要安装此包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请启动R并输入:

browseVignettes(“RTCGA.mutations”)

超文本标记语言 R脚本 使用RTCGA下载包含在RTCGA.mutations中的突变数据
PDF 参考手册
文本 新闻

细节

biocViews 注释数据ExperimentData
版本 20151101.18.0
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 3.2.0),RTCGA
进口
链接
建议 knitr
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports https://github.com/RTCGA/RTCGA/issues
全靠我
进口我
建议我 RTCGA
链接到我
构建报告

包档案

遵循bob 体育网址 在R会话中使用此包的说明。

源包 RTCGA.mutations_20151101.18.0.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/RTCGA.mutations
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/RTCGA.mutations
包短Url //www.anjoumacpherson.com/packages/RTCGA.mutations/
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  • 正常词 邮件列表——供包开发人员使用bob电竞体育官网